Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FGFR3P22607 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms