Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CSRP1P21291 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms