Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFTRP13569 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFTRP13569 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFTRP13569 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms