Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms