Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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