Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms