Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HMGB1P1B2RPK0 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMGB1P1B2RPK0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms