Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DKK3Q9UBP4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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