Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RRBP1Q9P2E9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RRBP1Q9P2E9 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms