Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SERINC1Q9NRX5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SERINC1Q9NRX5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms