Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCSER1Q9C0I3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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