Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms