Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM7Q9BQ49 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms