Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms