Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SCG3Q8WXD2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SCG3Q8WXD2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SCG3Q8WXD2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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