Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC12Q8WUD4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms