Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ANKRD42Q8N9B4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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