Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HECW1Q76N89 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HECW1Q76N89 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms