Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms