Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
WSCD1Q658N2 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms