Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FAM208BQ5VWN6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KIR2DL1-201ENST00000291633 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FAM208BQ5VWN6 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SPATA8-202ENST00000558553 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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FAM208BQ5VWN6 uc_338.24-201ENST00000617802 182 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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