Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SDK2Q58EX2 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms