Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC93Q567U6 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms