Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms