Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RRN3P1Q2M238 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms