Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RTL8BQ17RB0 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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