Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATP6V1FQ16864 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms