Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CNGA3Q16281 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNGA3Q16281 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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