Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKIV2LQ15477 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms