Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms