Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYCP1Q15431 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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