Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRKQ15262 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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PTPRKQ15262 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRKQ15262 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRKQ15262 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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PTPRKQ15262 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRKQ15262 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PTPRKQ15262 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRKQ15262 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
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