Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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PDCD1Q15116 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PDCD1Q15116 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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