Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SHPRHQ149N8 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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