Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NWD1Q149M9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NWD1Q149M9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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