Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNB1Q14721 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNB1Q14721 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms