Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTTNQ14247 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms