Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TOP3AQ13472 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TOP3AQ13472 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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