Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TTTY7-201ENST00000276770 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TTTY7B-201ENST00000276779 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 PDCL3P7-201ENST00000392251 712 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC023302.1-201ENST00000607458 492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC025268.1-201ENST00000632192 1199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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MKRN4PQ13434 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 DLEU1-201ENST00000378180 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MKRN4PQ13434 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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