Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AP3B2Q13367 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AP3B2Q13367 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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