Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC173Q0VFZ6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms