Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PPARDQ03181 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms