Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC106017.1-201ENST00000428348 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC007952.3-201ENST00000442355 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC007952.8-202ENST00000495691 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CPA1-207ENST00000484324 1303 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CACNA1BQ00975 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms