Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TAF6P49848 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TAF6P49848 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TAF6P49848 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms