Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VEGFBP49765 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZFYVE1-206ENST00000555072 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL158032.2-201ENST00000616818 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms