Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXC8P31273 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC8P31273 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms