Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYT1P21579 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYT1P21579 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms