Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP4AP20648 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms