Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EPCAMP16422 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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