Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DMDP11532 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 PDLIM1P1-201ENST00000604187 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DMDP11532 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DMDP11532 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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